Ethan Hunt je podezřelý ze smrti svých kolegů při tajné misi v Praze, protože záhadně přežívá jenom on. Brzy potkává agentku Claire, která ovšem také přežila - a oba začnou pátrat po tom, kdo je v CIA zrádce. Celý příběh se motá kolem seznamu agentů, díky kterému se snaží zjistit viníka.